Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms