Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms