Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms