Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP1Q9C000 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms