Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms