Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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