Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK4P57078 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms