Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms