Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms