Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms