Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms