Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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