Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LCN12Q6JVE5 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
LCN12Q6JVE5 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LCN12Q6JVE5 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LCN12Q6JVE5 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LCN12Q6JVE5 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LCN12Q6JVE5 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LCN12Q6JVE5 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676.1 ms