Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMN1Q16637 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMN1Q16637 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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