Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
KRT31Q15323 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
KRT31Q15323 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
KRT31Q15323 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KRT31Q15323 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms