Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPN13Q12923 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPN13Q12923 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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