Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USP18Q9UMW8 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
USP18Q9UMW8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP18Q9UMW8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP18Q9UMW8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP18Q9UMW8 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP18Q9UMW8 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP18Q9UMW8 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms