Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC1Q15751 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC1Q15751 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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