Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SLC9A3R2Q15599 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SLC9A3R2Q15599 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms