Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KARSQ15046 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KARSQ15046 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KARSQ15046 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KARSQ15046 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KARSQ15046 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KARSQ15046 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KARSQ15046 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KARSQ15046 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KARSQ15046 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KARSQ15046 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KARSQ15046 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KARSQ15046 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KARSQ15046 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KARSQ15046 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KARSQ15046 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KARSQ15046 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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