Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC3Q15034 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC3Q15034 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HERC3Q15034 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HERC3Q15034 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms