Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms