Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CKAP5Q14008 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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CKAP5Q14008 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
CKAP5Q14008 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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CKAP5Q14008 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP5Q14008 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CKAP5Q14008 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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