Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ALCAMQ13740 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ALCAMQ13740 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ALCAMQ13740 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ALCAMQ13740 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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