Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD10P28358 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD10P28358 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.3 ms