Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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SPG7Q9UQ90 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPG7Q9UQ90 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SPG7Q9UQ90 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SPG7Q9UQ90 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SPG7Q9UQ90 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SPG7Q9UQ90 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SPG7Q9UQ90 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SPG7Q9UQ90 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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SPG7Q9UQ90 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SPG7Q9UQ90 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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