Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.7 ms