Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SWI5Q1ZZU3 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SWI5Q1ZZU3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SWI5Q1ZZU3 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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