Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD1Q16676 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
FOXD1Q16676 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD1Q16676 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD1Q16676 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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