Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CTF1Q16619 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CTF1Q16619 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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CTF1Q16619 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CTF1Q16619 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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CTF1Q16619 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CTF1Q16619 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CTF1Q16619 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CTF1Q16619 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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