Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A3Q14050 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL9A3Q14050 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL9A3Q14050 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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