Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNX1Q13596 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNX1Q13596 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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SNX1Q13596 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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SNX1Q13596 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SNX1Q13596 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX1Q13596 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX1Q13596 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX1Q13596 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SNX1Q13596 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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