Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
BPTFQ12830 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
BPTFQ12830 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
BPTFQ12830 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
BPTFQ12830 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
BPTFQ12830 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
BPTFQ12830 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218 ms