Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SFTPDP35247 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SFTPDP35247 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SFTPDP35247 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.3 ms