Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VPREB1P12018 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
VPREB1P12018 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VPREB1P12018 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 820.2 ms