Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSPP1Q1MSJ5 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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