Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD1Q16676 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FOXD1Q16676 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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FOXD1Q16676 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXD1Q16676 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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FOXD1Q16676 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD1Q16676 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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