Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMN1Q16637 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMN1Q16637 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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