Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECM1Q16610 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECM1Q16610 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.3 ms