Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
KRT31Q15323 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRT31Q15323 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms