Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PKD2Q13563 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKD2Q13563 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKD2Q13563 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKD2Q13563 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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