Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEUROD1Q13562 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
NEUROD1Q13562 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEUROD1Q13562 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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