Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRDMT1O14717 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRDMT1O14717 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRDMT1O14717 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms