Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SOBPA7XYQ1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SOBPA7XYQ1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SOBPA7XYQ1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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