Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RTN1Q16799 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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RTN1Q16799 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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RTN1Q16799 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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RTN1Q16799 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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RTN1Q16799 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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RTN1Q16799 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RTN1Q16799 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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