Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMN1Q16637 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMN1Q16637 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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