Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SHPRHQ149N8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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SHPRHQ149N8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.12□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SHPRHQ149N8 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
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