Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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COL9A3Q14050 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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COL9A3Q14050 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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COL9A3Q14050 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
COL9A3Q14050 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL9A3Q14050 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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