Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3FQ13275 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEMA3FQ13275 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms