Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	SNORD18A-201	ENST00000363753	72 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNY1P8-201	ENST00000383970	114 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1126P-201	ENST00000384002	107 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-106P-201	ENST00000384405	107 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR644A-201	ENST00000385262	94 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	SNORD63B-201	ENST00000411005	70 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-664P-201	ENST00000362381	107 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNA5SP245-201	ENST00000364239	121 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.596-201	ENST00000410462	109 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	AC244505.6-201	ENST00000452829	130 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	AL035470.1-201	ENST00000622571	220 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.323-201	ENST00000365157	109 nt	BASIC	0.49	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR617-201	ENST00000385030	97 nt	BASIC	0.49	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-919P-201	ENST00000516731	104 nt	BASIC	0.49	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR4694-201	ENST00000578534	80 nt	BASIC	0.49	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR5087-201	ENST00000635826	76 nt	BASIC	0.49	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1064P-201	ENST00000410626	104 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU4-61P-201	ENST00000411243	107 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU7-61P-201	ENST00000515897	61 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU4-54P-201	ENST00000516428	129 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	SNORA25.18-201	ENST00000607153	114 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	VPS35-212	ENST00000640313	141 nt	TSL 5 BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.247-201	ENST00000364500	92 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1307P-201	ENST00000391012	103 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6ATAC41P-201	ENST00000408600	126 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	SNORA7.5-201	ENST00000410672	110 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR2052-201	ENST00000636055	55 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	AC091304.10-201	ENST00000641554	121 nt	BASIC	0.48	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR103A1-201	ENST00000362165	78 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-170P-201	ENST00000362832	104 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.96-201	ENST00000363092	109 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	SNORD118-201	ENST00000363593	134 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.423-201	ENST00000384057	113 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR34C-201	ENST00000384831	77 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	AL157398.1-201	ENST00000452981	186 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR8066-201	ENST00000617280	78 nt	BASIC	0.47	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1290P-201	ENST00000362957	109 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-1125P-201	ENST00000363601	107 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORA2A-201	ENST00000383885	135 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-480P-201	ENST00000384332	107 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-880P-201	ENST00000384526	107 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	AL162399.1-201	ENST00000426090	130 nt	TSL 3 BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-313P-201	ENST00000516317	112 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.163-201	ENST00000363702	113 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.261-201	ENST00000364631	102 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORA8.2-201	ENST00000384372	139 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR548G-201	ENST00000408442	89 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU7-195P-201	ENST00000458793	62 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNA5SP395-201	ENST00000516567	118 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNA5SP94-201	ENST00000516917	108 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR4514-201	ENST00000581410	57 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR4439-201	ENST00000583746	80 nt	BASIC	0.46	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.78-201	ENST00000362970	110 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.377-201	ENST00000365644	108 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORA19.1-201	ENST00000410656	129 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORA40.8-201	ENST00000411034	126 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SPINT5P-201	ENST00000448174	155 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR4536-1-201	ENST00000583537	88 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.818-201	ENST00000618813	71 nt	BASIC	0.45	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU2-59P-201	ENST00000410482	191 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNA5SP47-201	ENST00000517230	109 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-86P-201	ENST00000606534	107 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	uc_338.17-201	ENST00000619633	179 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	FAM135A-203	ENST00000370479	5930 nt	TSL 1 (best) BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORA36.1-201	ENST00000363424	132 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6ATAC4P-201	ENST00000387446	126 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNA5SP299-201	ENST00000391203	116 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORD71-201	ENST00000411292	86 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.659-201	ENST00000515994	113 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	AC141557.1-201	ENST00000540982	400 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	AL513043.2-201	ENST00000573941	143 nt	BASIC	0.44	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SNORD58A-201	ENST00000383875	65 nt	BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-44P-201	ENST00000384045	107 nt	BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	AL357793.1-201	ENST00000448412	401 nt	TSL 5 BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	SCARNA23-201	ENST00000516060	130 nt	BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-537P-201	ENST00000517277	103 nt	BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	NFIA-AS1-206	ENST00000630199	220 nt	TSL 5 BASIC	0.43	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-945P-201	ENST00000383947	107 nt	BASIC	0.42	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.467-201	ENST00000384297	102 nt	BASIC	0.42	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR599-201	ENST00000385069	95 nt	BASIC	0.42	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR6759-201	ENST00000638110	65 nt	BASIC	0.42	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR181B2-201	ENST00000385004	89 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR519A1-201	ENST00000385257	85 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU7-106P-201	ENST00000459514	67 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	ST7-OT3_3.1-201	ENST00000611709	115 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	MIR6718-201	ENST00000616153	80 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	HOXA11-AS1_6.1-201	ENST00000620092	179 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	CCDC7-215	ENST00000639629	4158 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.173-201	ENST00000363776	113 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-1014P-201	ENST00000383940	103 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	RNU6-972P-201	ENST00000391208	107 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	HAR1A.1-201	ENST00000459583	118 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.677-201	ENST00000516401	85 nt	BASIC	0.41	□□□□□ -2.34
TAF1	P21675	Y_RNA.348-201	ENST00000365403	103 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1113P-201	ENST00000384348	107 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR216B-201	ENST00000390186	82 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-554P-201	ENST00000410466	106 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-887P-201	ENST00000410660	100 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	LINC00345-201	ENST00000443679	285 nt	TSL 5 BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-848P-201	ENST00000515948	107 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms